正常情况下，选择 Cygwin的反安装时最好的选择。
当反安装被破坏之后，删除就有点麻烦了
Cygwin模拟了Linux的权限管理体系，这跟Windows的默认权限管理有些冲突。当使用右键查看属性中的安全选项夹时，可以看到“组或用户名”一栏，有无法识别的用户（带有问号），它们是我重装系统以前的用户，那串数字是唯一识别号，尽管我的用户名没有改，但是它的唯一的识别号是完全不同的，所以目前登录的帐号对文件没有修改和删除的权限。
手动删除是件非常痛苦的事。方法是，选择“安全—高级”，首先修改所有者，编辑为目前的帐户名或者“administrator”，然后选择
“权限”，更改当前自己当前账户的权限，将其修改成“完全控制”，然后那个文件就可以删除。如果要删除一个文件夹的话，需要其文件夹下的所有文件和文件夹都修改了权限才能顺利删除。
TakeOwn.exe是一个非常好的应用程序，很好的解决的修改文件宿主的问题。
只要把TakeOwn.exe拷贝到Cygwin目录下， 在CMD模式下，输入：
takeown /F you_dir_name /R /D N
就可以了。
如果还不不能删除再查看下权限，就会发现用户还不具有删除和修改的权限。
添加上就好了，这下终于可以轻松干掉Cygwin了。
原出处不详...